Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP6P55212 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP6P55212 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP6P55212 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms