Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARSP54136 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARSP54136 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RARSP54136 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARSP54136 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARSP54136 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARSP54136 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms