Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3M2P53677 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms