Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACLYP53396 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACLYP53396 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACLYP53396 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms