Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 RPL9BYNL067W 576 nt3.31□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YBL073WYBL073W 312 nt3.31□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YHR078WYHR078W 1659 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 FOX2YKR009C 2703 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 BIT61YJL058C 1632 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 ISF1YMR081C 1017 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 GIS2YNL255C 462 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 TIM12YBR091C 330 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 KIN2YLR096W 3444 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 COX1Q0045 1605 nt3.3□□□□□ -1.88
RAI1P53063 SPP382YLR424W 2127 nt3.29□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YFL063WYFL063W 456 nt3.29□□□□□ -1.88
RAI1P53063 RPS21AYKR057W 264 nt3.29□□□□□ -1.88
RAI1P53063 FCF2YLR051C 654 nt3.29□□□□□ -1.88
RAI1P53063 snR191snR191 274 nt3.29□□□□□ -1.88
RAI1P53063 SSY1YDR160W 2559 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 RDS1YCR106W 2499 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 NOT5YPR072W 1683 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 RSC1YGR056W 2787 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YDR250CYDR250C 276 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 YPL229WYPL229W 621 nt3.28□□□□□ -1.88
RAI1P53063 REG1YDR028C 3045 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 TFB1YDR311W 1929 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 JEN1YKL217W 1851 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RPS28BYLR264W 204 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 PDR12YPL058C 4536 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 VTC4YJL012C 2166 nt3.27□□□□□ -1.89
RAI1P53063 GLC3YEL011W 2115 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 IOC3YFR013W 2364 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 TPS2YDR074W 2691 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 USE1YGL098W 738 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YOP1YPR028W 543 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 PCF11YDR228C 1881 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 URA2YJL130C 6645 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 MSH2YOL090W 2895 nt3.26□□□□□ -1.89
RAI1P53063 NCE101YJL205C 162 nt3.25□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.25□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RPS7AYOR096W 573 nt3.25□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YPR077CYPR077C 372 nt3.25□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YNL034WYNL034W 1839 nt3.25□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YJL016WYJL016W 1686 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RPL30YGL030W 318 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YIL058WYIL058W 285 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YJL015CYJL015C 285 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RPL26AYLR344W 384 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 COX7YMR256C 183 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 ATP15YPL271W 189 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 SAF1YBR280C 1914 nt3.24□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RAD5YLR032W 3510 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 COX23YHR116W 456 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 PSY1YKL076C 384 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 SIP3YNL257C 3690 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 SWD3YBR175W 948 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 ENA2YDR039C 3276 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 ENA1YDR040C 3276 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 RRP5YMR229C 5190 nt3.23□□□□□ -1.89
RAI1P53063 APC11YDL008W 498 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YDL011CYDL011C 324 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 TMA22YJR014W 597 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 AIM26YKL037W 357 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 ESF2YNR054C 951 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 SIZ1YDR409W 2715 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 VPS52YDR484W 1926 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 AUS1YOR011W 4185 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 SET1YHR119W 3243 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 VPS3YDR495C 3036 nt3.22□□□□□ -1.89
RAI1P53063 ECM5YMR176W 4236 nt3.21□□□□□ -1.89
RAI1P53063 NPR1YNL183C 2373 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 YDL041WYDL041W 354 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 RPS23AYGR118W 438 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 NUP82YJL061W 2142 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 UTP30YKR060W 825 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 JIP5YPR169W 1479 nt3.21□□□□□ -1.9
RAI1P53063 OSH6YKR003W 1347 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 MDN1YLR106C 14733 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 YPK1YKL126W 2043 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 TCP1YDR212W 1680 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 RKM1YPL208W 1752 nt3.2□□□□□ -1.9
RAI1P53063 NAN1YPL126W 2691 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 GYP7YDL234C 2241 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 WIP1YDR374W-A 270 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 CYC7YEL039C 342 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 YGR265WYGR265W 411 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 YBR137WYBR137W 540 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 MYO5YMR109W 3660 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 SPT10YJL127C 1923 nt3.19□□□□□ -1.9
RAI1P53063 ARO80YDR421W 2853 nt3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms