Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPT1P50897 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPT1P50897 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPT1P50897 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms