Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms