Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI2P48788 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms