Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A3P48751 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A3P48751 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms