Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLCP48506 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLCP48506 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLCP48506 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCLCP48506 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCLCP48506 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLCP48506 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms