Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GALR1P47211 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GALR1P47211 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GALR1P47211 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GALR1P47211 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GALR1P47211 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms