Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms