Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RANGAP1P46060 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms