Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC1A1P43005 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms