Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFRP42898 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFRP42898 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms