Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4KAP42356 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PI4KAP42356 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms