Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH1P40692 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLH1P40692 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLH1P40692 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms