Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX2P40425 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX2P40425 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PBX2P40425 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBX2P40425 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PBX2P40425 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PBX2P40425 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms