Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2IP36954 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms