Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSG3P32926 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSG3P32926 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG3P32926 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG3P32926 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms