Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA3P32297 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms