Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms