Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms