Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRPAP1P30533 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRPAP1P30533 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms