Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP1P29466 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP1P29466 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms