Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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