Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms