Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA2P24043 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA2P24043 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA2P24043 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA2P24043 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA2P24043 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms