Protein–RNA interactions for Protein: P23919

DTYMK, Thymidylate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTYMKP23919 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTYMKP23919 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms