Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPREP23469 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPREP23469 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPREP23469 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms