Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGFR3P22607 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms