Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms