Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms