Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD58P19256 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD58P19256 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD58P19256 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD58P19256 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD58P19256 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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