Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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