Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms