Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XBP1P17861 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XBP1P17861 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XBP1P17861 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XBP1P17861 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms