Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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