Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCHL3P15374 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms