Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms