Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIP12755 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIP12755 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIP12755 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIP12755 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIP12755 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIP12755 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms