Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms