Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1P11387 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1P11387 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP1P11387 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms