Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2P10911 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2P10911 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2P10911 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2P10911 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCF2P10911 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2P10911 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2P10911 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms