Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L5P0DN76 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms