Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms