Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA1P0DJI8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms