Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms