Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM3P06753 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM3P06753 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms