Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms